汇总：生物信息学都用数据库、软件及下载链接

NCBI []

NCBI (National Center for Biotechnology Information）是所指澳大利亚国立生可作新技术文档中的心

EMBL []

欧洲分子本体生可作学实验室室EMBL（The European Molecular Biology Laboratory）

DDBJ []

DDBJ(DNA Data Bank of Japan)，于1984年建立，是世界性三大DNA 资料库之一，与NCBI的GenBank，EMBL的EBI资料库共同均是由InternationalDNA资料库

CNGB []

中的国各地区资料库（China National GeneBank）座落在珠海市大鹏另行区，是继世界性三大资料库以后的亚太地区第四大各地区级资料库。它是中的国首个，也是唯一一个各地区细胞核质库，相对于亚太地区另外三个细胞核质库而言，各地区细胞核质库样品存放的为数、存储量和可访问的数据量亦非是亚太地区最大者。

BIGD []

中的国各地区细胞核质组科学数据中的心 生命与健康大数据中的心 (National Genomics Data Center BIG Data Center)

miRBase []

piRNAbank []

piRNAbank []

SILVA []

LncRNAdb []

真核生可作

LncRNAwiki [_Page]

人类长非序列RNA资料库

Rfam[]

类似于Pfam的RNA家氏族注解资料库

Human protein atlas [ ]

人体细胞核在细胞核、的组织、生理必须下的暗示

Pfam []

Pfam是细胞核质家氏族的资料库，除此以外使用凝形式化假设生成的注解和多数列统计分析。

SwissProt []

手动注解的非举例来说细胞核数列资料库

UniProt [ ]

PIR []

Antibodies []

BRENDA [ ]

HPRD []

InterPro []

通过整合多个细胞核的系统性资料库，提供了一个方便的对细胞核数列同步进行功用注解的平台，除此以外对细胞核质家氏族、本体域、功用位点的得出

iProClass []

PRF []

REBASE []

PDB []

通过实验室测实有的本体

SCOP []

CATH []

PSI []

PROSITE []

最全面

Pfam []

最专业

ProDom []

CCD []

Prints []

SMART [ ]

TIGRFAM []

STRING []

DIP []

实验室验证的细胞核相互依赖性资料库

BioGRID [] ：

IntAct [ ]

MapMan：一个功用强大的糖类途径查看和主编软件

KEGG []

GO []

NCBI BioSystems []

IMP []

plantCyc []

MANET [ ]

MetaNetX [ ]

MataboLights []

HMDB []

YMDB []

ECMDB []

Planteome []

dbGaP []

IPPN []

GeneCard []

Gene Wiki[_Wiki ]

Blast []

Interproscan []，

WEGO []

KAAS []

FGENESH []

AUGUSTUS [ ]

GENESCAN []

GeneMark []

Glimmer []

Exon-Intron Graphic Maker []

根据候选细胞核质的氨基酸和内含子等文档素描细胞核质本体

Blastp [_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome]

可该软件得到细胞核本体域的注解和位置文档

ArrayExpress [ ]

数据来自EMBL的核酸功用细胞核质组学实验室的数据；

BAR []

在统计分析细胞核质功用时，不一实有会参考细胞核质的暗示方式而，即细胞核质在植可作完全相同的组织完全相同胚胎发育初期的暗示金属量变动。通过该软件统计分析网上BAR对候细胞核质同步进行暗示统计分析。 是一个植可作生信统计分析水资源网上，用该网上统计分析细胞核质暗示时，不仅可以获得细胞核质暗示方式而的热图，还可以获得图形的射频荧光图片，准确显现细胞核质在植可作的组织中的的暗示位置。

GSDS []

Gene Structure Display Server，基于细胞核质组注解文件素描数列细胞核质本体等功用

ProtParam []

细胞核特性统计分析是所指细胞核的一些可作理和药理学给实有，如分子本体量、等电点、和原子均是由、消光系数、半衰、不稳实有系数、脂肪氏族所标准普尔、亲沙质。这些给实有，有助于同步进行细胞核的的系统性生化实验室。比如在游离体系（大肠致病、糖类等）暗示和纯化目的细胞核时，需要考虑细胞核的分子本体量、等电点、消光系数、不稳实有系数和亲沙质等。在底物能活实验室中的，也需要根据这些给实有构建实验室体系。

Protscale []

细胞核的是非沙质主要由其侧碱基官能团R，如果R只是H或是C、H两元素均是由的话，都是均匀分布的，如果含有磁性侧碱基官能团，如-OH、-SH、-COOH、-NH2 等，则就是磁性的（水岸的）。疏沙质有组氨酸、色氨酸、苯乙酰、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、乙酰和蛋氨酸（甲硫氨酸）。疏沙质在细胞核质内部，在保持细胞核质的三级本体上，底物和胶体、抗体和抗原间的相互依赖性等各种非共价键的分子本体联结方面，具有关键性依赖性。

TMHMM []

细胞核的地区性腹高音本体统计分析对于得出细胞核的亚细胞核适配密切的系统性。如果具有地区性腹高音本体，细胞核很似乎适配于细胞核中的与腹高音的系统性的本体，如细胞核质腹高音、叶绿体腹高音或线粒体腹高音等内腹高音的系统。此外，细胞核地区性腹高音本体统计分析对于细胞核功用统计分析也有一实有的尽力。比如某细胞核没有地区性腹高音本体，但是亚细胞核适配实验室显示其可适配于腹高音的系统性本体，这说明该细胞核似乎通过其他腹高音适配细胞核雇用过去的。

SignalP []

穹丘讯号位置为讯号肽切割点，穹丘以后的数列为讯号肽

讯号肽是所指驱使另行催化的细胞核质向激素通路移到的短肽碱基，常座落在细胞核的N-末端，全权负责把细胞核质驱使到完全相同腹高音本体的亚细胞核器内。序列激素细胞核的mRNA在英文翻译时首先催化N末端的讯号肽，它被讯号肽辨别细胞核(SRP)所辨别，SRP将转录携带至转录上，转录腹高音上的 SPR 受体辨别并与之联结。另行催化细胞核在讯号肽驱使下驶出转录内高音，而讯号肽则在讯号肽底物的依赖性下被切除。由于它的驱使，另行生的就并能通过转录腹高音进入高音内，终于被激素到胞外。在宿主菌中的暗示其会细胞核时，可用讯号肽驱使其会细胞核适配激素到胞外，提高细胞核可溶性，在脱氧核糖核酸暗示的系统（大肠致病、芽孢致病等）和真核暗示的系统（如毕赤糖类）中的均有广泛应用。

NetPhos []

KinasePhos-2.0 []

细胞核质一氧化氮所指由细胞核质激底物催化的把 ATP 的磷酸基移到真的可作细胞核质肽键（糖类、苏氨酸、组氨酸）上的步骤，或者在讯号依赖性下联结 GTP（不一实有以 GTP 取代 GDP），是微生可作内一种比如说的管控作法，在细胞核讯号转导的步骤中的起关键性依赖性。在讯号达到时通过获得一个或几个磷酸该集团而被激能活，而在讯号增强时能去除这些该集团，从而失去能活性。有时某个讯号细胞核一氧化氮不一实有造成下游的细胞核依次时有发生一氧化氮，形成一氧化氮小分子加成。

二、生可作文档学软件及下载URL：

Clustal:

MEGA:

MAFFT:

Sequence Matrix:

PGDSpider:

DnaSP v6:

Arlequin:

MapMan：

PartitionFinder:

jModelTest:

IQ-TREE:

IQ-TREE该软件:

RaxmlGUI:

Mrbayes 3.2.7:

PhyloSuite:

BEAST:

Figtree:

Tracer:

PopART:

Network:

Structure:

CLUMMP:

Distruct:

Migrate-N:

Phylonet: 或