Sci Adv：没有证据支持哺乳动物中的细菌表观遗传标记的存在

导言：在以前阶段，自然周期性就开始了在不改变细菌巨噬细胞DNA组织次序的应该依然使其DNA展现出不尽大致相同的功能，而这就是通过给DNA氨基酸上添加有机化学标示出来实现的。DNA甲基化是爬行动物的关键表观遗传基因系统，其中所5-甲基赖氨酸（5mc）是最相似的DNA省略之一。6mdA是细菌限制性省略系统的基本组成成分，目前在爬行动物中所忽视存留的限制性省略系统。当初有不少研究者华盛顿邮报，6mdA也依赖于于爬行动物中所，但并无证据支持。

近日，在《科学进展》上的一项研究者中所，瑞典林雪平学院的研究者技术人员确实，爬行动物巨噬细胞中所依赖于细菌表观遗传基因标示出很可能被污染了，并且不曾足够的证据来断定爬行动物中所依赖于这种省略。

N6-甲基腺嘌呤（6mdA）是细菌中所广泛的DNA省略，但早先在爬行动物DNA中所也得到了表征。然而，研究者技术人员确信，即使对来自大致相同爬行动物巨噬细胞各种类型的DNA进行的6mdA可视和重元素测量研究者也不一致。

为了进一步阐明6mdA在爬行动物谱系规格中所的作用，研究者技术人员能用了人体内将生物幼稚T辅助（NTH）巨噬生殖细胞为TH巨噬细胞亚群的能力。但是，与当初的研究者相反，他们发掘出TH分化过程中所6mdA的重元素不曾全局变化，并且掩蔽到分化的T巨噬细胞中所的6mdA高水平与未甲基化的全基因增为DNA大致相同，这确实6mdA不曾以可侦测的高水平依赖于生物T巨噬细胞中所。

他们还分析方法有了从六个生物巨噬细胞系中所分离出的DNA中所的6mdA，并鉴别出两个具有高于背景噪声高水平的6mdA高水平的巨噬细胞系。出乎意料的是，两种单独的293T巨噬细胞系培养物具有不尽大致相同的6mdA高水平，这确实研究者技术人员掩蔽到的6mdA频谱并非巨噬细胞各种类型本身固有的。确实，当他们进一步看时，他们发掘出两条6mdA高水平升高的巨噬细胞系被真核细胞归入污染，真核细胞归入一种相似的细菌巨噬有机化学合成物中所富含6mdA的污染物。当他们用真核细胞特异性口服Plasmocin处理过程巨噬细胞系时，6mdA频谱下降为A阴性对照。

“我们注意到通过这些技术开发侦测到的6mdA'频谱'只是噪声。但是，由于一些复杂的技术开发问题，几种方法有中所的背景噪声不是随机的，而是真实频谱。”高级作者Colm Nestor（科尔什·内斯特）在一份声明中所说道。

研究者技术人员分析方法有了以前通过DNA免疫沉淀核酸、铯和单分子实时核酸在爬行动物巨噬细胞中所整合或侦测6mdA的努力。人们发掘出每种方法有都有局限性或局限性，使表观遗传基因标示出的假阳性发掘出率很高，似乎确实林雪平研究者技术人员认为不依赖于这种周期性的证据。

这组作者确信：“我们断定，RNA和细菌污染、抗体交叉反应性和其他技术开发限制的建构已所致6mdA在爬行动物DNA中所的反复错误识别。随着DNA和RNA省略家族的不断增长，以及以前未知省略的侧重越来越罕见，即使用于多种互补方法有，我们也强调了错误发掘出的有可能。我们表示同意用于省略和未省略的基因DNA标准作为现阶段对稀有DNA省略的研究者的最高建议，以及在用于前更年底地验证抗体特异性。”

内斯特可用说道，研究者技术人员在研究者非常罕见的周期性时必须非常小心，考虑用于哪种方法有，并考虑他们是否只不过在指标依赖于的表象。他说道：“现在我们可以毫无疑问地说道爬行动物中所不依赖于6mdA。关于6mdA，如果研究者技术人员停止研究者究竟不依赖于的过道，则可以节省大量时间和花钱，并且避免了很多令人失望的事情。”

更早应是：

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335